Сегодня Ярославская таможня отмечает 23 года со дня своего образования. Интересно, что первоначально в ее структуру входили Костромской и Ивановский таможенный посты, а штатная численность новорожденной таможни вместе с постами составляла всего 13 человек.
В 2012 году в рамках оптимизации таможенной инфраструктуры к Ярославской таможне присоединена Костромская таможня в составе двух таможенных постов (Костромской и Шарьинский). Теперь в зону ответственности таможни входят Ярославская и Костромская области.
На сегодняшний день в составе Ярославской таможни функционируют семь таможенных постов. В зоне ответственности Ярославской таможни функционируют 10 складов временного хранения, в том числе три открытого и семь закрытого типа, 13 постоянных зон таможенного контроля. Коллектив таможни насчитывает 349 квалифицированных специалистов.