В Митрополичьих палатах представлены иконы из коллекции Ярославского художественного музея, одного из богатейших собраний древнерусского искусства в России. Новая экспозиция включает около 100 произведений начала XIII – конца XVII веков.
Экспозицию открывает древнейший памятник музейной коллекции, единственная домонгольская икона, экспонируемая в Ярославле, шедевр древнерусской иконописи – «Спас Вседержитель» начала ХIII в. В состав коллекции входит знаменитая чудотворная икона «Богоматерь Толгская» начала XIV века, которая с 2003 года находится в Крестовоздвиженском соборе Толгского монастыря и остается под наблюдением и постоянным контролем музейного хранителя.
В зале ранних памятников экспонируется вернувшийся после сложной реставрации памятник XV века «Николай Чудотворец с клеймами жития», а также известные, любимые зрителем иконы «Илья Пророк в пустыне», «Богоматерь Иерусалимская» и трехфигурный Деисус из церкви Параскевы Пятницы на Всполье (разрушена в 1930-е гг.).
Экспозиция Митрополичьих палат представляет четыре века ярославской иконописи и знакомит зрителей с выдающимися произведениями художественной традиции города.